Изучение корреляционных связей и генетических ассоциаций промеров у самок северных оленей (Rangifer tarandus) ненецкой породы

Обложка

Цитировать

Полный текст

Аннотация

Племенной потенциал оленеводства определяется грамотной работой с генетическими ресурсами, поэтому изучение фенотипических признаков северных оленей необходимо проводить в комплексе с изучением особенностей их генофондов. В работе проведен анализ корреляционных связей и генетических ассоциаций фенотипических признаков у 98 самок северных оленей (Rangifer tarandus) ненецкой породы в возрасте от 3 до 9 лет в сравнительном аспекте по основным промерам тела и индексам телосложения, вычисленных по этим промерам. Для анализа использовали панель 16 микросателлитных локусов (BMS1788, RT30, RT1, RT9, C143, RT7, OHEQ, FCB193, RT6, C217, RT24, C32, BMS745, NVHRT16, T40 и C276). Поиск взаимосвязей между генотипом и фенотипом северных оленей был выполнен с помощью регрессионного анализа; только для трех фенотипических признаков – высота в холке, глубина груди и индекс растянутости – была выявлена ненулевая наследуемость. С помощью корреляционного анализа установлено, что живая масса взрослых самок с учетом возраста и генетического родства, имеет высокую положительную корреляцию с высотой в холке (r ≈ 0.70), обхватом груди (r ≈ 0.79) и глубиной груди (r ≈ 0.73).

Об авторах

Г. Р. Свищёва

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук; Федеральный исследовательский центр, Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: gulsvi@mail.ru
Россия, Москва; Россия, Новосибирск

М. Т. Семина

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Email: stolpovsky@mail.ru
Россия, Москва

Е. А. Коноров

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Email: stolpovsky@mail.ru
Россия, Москва

Э. А. Николаева

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Email: stolpovsky@mail.ru
Россия, Москва

С. Н. Каштанов

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Email: stolpovsky@mail.ru
Россия, Москва

К. А. Лайшев

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук; Санкт-Петербургский федеральный исследовательский центр РАН

Email: stolpovsky@mail.ru
Россия, Москва; Россия, Санкт-Петербург

А. А. Южаков

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук; Санкт-Петербургский федеральный исследовательский центр РАН

Автор, ответственный за переписку.
Email: alyuzhakov@yandex.ru
Россия, Москва; Россия, Санкт-Петербург

Ю. А. Столповский

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова Российской академии наук

Автор, ответственный за переписку.
Email: stolpovsky@mail.ru
Россия, Москва

Список литературы

  1. Деряженцев В., Шифнер К. Наследственность и коррелятивные связи некоторых хозяйственно-полезных признаков северных оленей / Науч. тр. Магадан. зон. НИИСХ Северо-Востока. 1978. Вып. 7. С. 4–11.
  2. Дьяченко Н. Рекомендации по племенной работе в северном оленеводстве. Норильск: НИИСХ Крайнего Севера, 1970. 82 с.
  3. Мухачев А. Морфологические особенности и мясная продуктивность северных оленей Полярного Урала: Дис. … канд. биол. наук. М.: ВСХИЗО, 1968. 240 с.
  4. Рожков Ю., Проняев А. Коэффициент сходства между популяциями по количественным признакам и генотипам // С.-х. биол. 1992. № 6. 26–35.
  5. Семина М., Каштанов С., Бабаян О. и др. Анализ генетического разнообразия и популяционной структуры ненецкой аборигенной породы северных оленей на основе микросателлитных маркеров // Генетика. 2022. Т. 58 (8). С. 954–966.
  6. Югай В. Экстерьерные особенности северных оленей в условиях Ямала // Аграр. вестн. Урала. 2009. № 10 (64). С. 48–51.
  7. Южаков А. О наследуемости и повторяемости живой массы у северных оленей // Сиб. вестн. с.-х. науки. 2003. № 3 (149). С. 165–168.
  8. Южаков А., Романенко Т., Лайшев К. Феногеографическая изменчивость северных оленей ненецкой породы // Изв. СПб. гос. аграр. ун-та. 2017. № 2 (47). С. 115–122.
  9. Adamack A.T., Gruber B. PopGenReport: simplifying basic population genetic analyses in R // Meth. Ecol. Evol. 2014. V. 5 (4). P. 384–387.
  10. Agapow P.M., Burt A. Indices of multilocus linkage disequilibrium // Mol. Ecol. Notes. 2001. V. 1 (1–2). P. 101–102.
  11. Belonogova N.M., Svishcheva G.R., Axenovich T.I. FREGAT: an R package for region-based association analysis // Bioinformatics. 2016. V. 32 (15). P. 2392–2393. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btw160
  12. Dodokhov V., Pavlova N., Rumyantseva T., Kalashnikov L. Genetic characteristics of the even breed of deer in Yakutia // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science / Int. sci. and technol. conf. “Earth science”. Vladivostok, Russian Federation, 08–10 December, 2020. Vladivostok: IOP Publishing Ltd, 2021. V. 666 (2). Art. 032063.
  13. Goudet J. HIERFSTAT, a package for R to compute and test hierarchical F-statistics // Mol. Ecol. Notes. 2005. V. 5 (1). P. 184–186.
  14. Gruber B., Adamack A.T. Landgenreport: a new R function to simplify landscape genetic analysis using resistance surface layers // Mol. Ecol. Res. 2015. V. 15 (5). P. 1172–1178.
  15. Holand H., Kvalnes T., Røed K. H. et al. Stabilizing selection and adaptive evolution in a combination of two traits in an arctic ungulate // Evolution. 2020. V. 74 (1). P. 103–115.
  16. Jombart T. adegenet: a R package for the multivariate analysis of genetic markers // Bioinformatics. 2008. V. 24 (11). P. 1403–1405.
  17. Kamvar Z.N., Tabima J.F., Grünwald N.J. Poppr: an R package for genetic analysis of populations with clonal, partially clonal, and/or sexual reproduction // Peer J. 2014. V. 2. P. e281.
  18. Muuttoranta K., Holand Ø., Røed K.H. et al. Genetic and environmental effects affecting the variation in birth date and birth weight of reindeer calves // Rangifer. 2013. V. 33 (1). P. 25–35.
  19. Muuttoranta K., Holand Ø., Røed K.H. et al. Genetic variation in meat production related traits in reindeer (Rangifer t. tarandus) // Rangifer. 2014. V. 34 (1). P. 21–36.
  20. Muuttoranta K., Nieminen M., Mäki-Tanila A. Estimating maternal effects on growth of reindeer (Rangifer t. tarandus) // Proc. of the 9th World congress on genetics applied to livestock production, Leipzig, Germany, 1st–6th August, 2010. 2010. 4 p.
  21. Paradis E. Pegas: an R package for population genetics with an integrated-modular approach // Bioinformatics. 2010. V. 26 (3). P. 419–420.
  22. Stolpovsky Y.A., Babayan O., Kashtanov S. et al. Genetic evaluation of the breeds of reindeer (Rangifer tarandus) and their wild ancestor using a new panel of STR markers // Russ. J. Genet. 2020. V. 56 (12). P. 1469–1483.
  23. Svishcheva G., Babayan O., Sipko T. et al. Genetic differentiation between coexisting wild and domestic reindeer (Rangifer tarandus L. 1758) in Northern Eurasia // Genet. Res. 2022. V. 3 (6). P. 1–14.
  24. Wilson A.J., Kruuk L.E., Coltman D.W. Ontogenetic patterns in heritable variation for body size: using random regression models in a wild ungulate population // Am. Nat. 2005.V. 166 (6). P. E177–E192.

Дополнительные файлы


© Российская академия наук, 2023